推荐产品
公司新闻/正文
江西江蓝纯参加浙江大学基因组科学研究班学习
人阅读 发布时间:2020-01-10 10:52
在上周,我公司参加了浙江大学基因组科学研究班学习,内容很丰富哦。
一、培训班上课内容
上课内容涵盖“基因组学―蛋白质组学―系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
核心课程包括:
1.基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展
2.转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学
3.系统生物学建模分析及高通量分析技术应用
4.蛋白质组学概论及应用
二、培训班上机内容
上机实习课采用 “跟我学”方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下:
实习一:基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二:转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法; 利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
实习四:蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
实习五:蛋白质组质谱分析
使用X!Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
三、培训对象
1.无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;
2.计划开展各类组学研究的科研人员;
3.已有组学数据需了解分析方法的研究人员;
4.有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。
一、培训班上课内容
上课内容涵盖“基因组学―蛋白质组学―系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
核心课程包括:
1.基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展
2.转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学
3.系统生物学建模分析及高通量分析技术应用
4.蛋白质组学概论及应用
二、培训班上机内容
上机实习课采用 “跟我学”方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下:
实习一:基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二:转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法; 利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
实习四:蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
实习五:蛋白质组质谱分析
使用X!Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
三、培训对象
1.无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;
2.计划开展各类组学研究的科研人员;
3.已有组学数据需了解分析方法的研究人员;
4.有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。